С июня по август 1944 года 50-ая Армия участвует в сражениях Белорусской стратегической операции «Багратоин». Соединения армии, преодолевая сопротивление немецких войск, с боями прошли свыше 500 км, форсировали реки Березина, Неман, разгромили окружённого противника юго-восточнее и южнее белорусской столицы города Минска, а также Могилёв, Быхов, Новогрудок, Лида, Скидель, Гродно. В начале 1945 года 50-я армия в Восточно-Прусской стратегической операции (13 января — 25 апреля). 6 — 9 апреля 1945 года войска армии участвовали в штурме Кёнигсберга, боевые действия 50-я армия закончила с выходом на побережье Вислинского залива Балтийского моря.